尾声
离开中庆的那一日，许多平民百姓自发赶到南门，为段功送行。山云变，寒涛卷，万事付空烟。伤心泪，精魂显，悲愤向谁言。
凌云死后不久，梁王即派兵重重围困住忠爱宫，将杨宝等人软禁在其中，杨宝派出赶回大理报信的羽仪也尽数被梁王派人捕获囚禁。唯有段僧奴一人因有人暗中协助，成功逃回大理。过得十数日，大理往东面边境集结重兵，剑拔弩张。在行省马哈只、鹤庆知事杨昇等人斡旋下，梁王终于同意放杨宝等人护送段功灵柩回大理。
离开中庆的那一日，许多平民百姓自发赶到南门，为段功送行。山云变，寒涛卷，万事付空烟。伤心泪，精魂显，悲愤向谁言。
段功在通济桥上中箭落马时，爱马乌云托月受惊逸去，莫知所往，此刻又自行出现，默默守护在段功灵柩旁边。同样令人惊讶的还有阿盖，她换上一身素服，捧着段功的乌钢剑，坚持要跟随去大理。
段功终于回到了故乡，由于他是第一位死在大理之外的总管，尸体来不及处理，已经溃烂，所以没有采取传统的双耳金瓶的归葬方式，而是土葬在崇圣寺，其墓至今尚存。大树枝繁叶茂，郁郁葱葱，伴着巍峨的高山，生生不息，绿满人间，恰似他那不死的精魂，永不变色。大理最大的秘密双耳金瓶随着他的死去长埋地底，再无人知晓。
相比于悲摧肝肠、痛不欲生的高兰，段僧奴要冷静得多。她走近阿盖，冷冷道：“请你交还我阿爹的乌钢剑。”阿盖道：“可这是阿奴送给我的定情信物。”段僧奴不由分说，上前一把夺过剑来，冷笑道：“你配么？”拔剑出来，稍微一舞动，宝剑吐出圈圈寒光，犹如点点霜花缠绕剑锋。随即目光炯炯凝视着阿盖，一字一句地道：“我段僧奴在此立誓，定要用此剑斩下梁王的人头。”那种不加掩饰的恨，仿若烈焰一般尽可以吞噬一切。
爱人已逝，音容笑貌，恍如昨日，可活着的人还要遭受更多痛苦。阿盖茫然流落在阳苴咩城街头，她知道大理人不欢迎她，认为是她害死了段功，所以她要离开这里，临行前来做最后的流连。
行走在平实的石板路上，小城依旧是那么平淡祥和，甚至连叹息都不曾有。男人英姿潇洒，女人妩媚靓丽，洋溢着生机勃勃的生命之气。她身为公主，原也不过是这卑微众生中的沧海一粟。
一位老阿婆正站在街边卖雪，若能将人生融入这清甜的雪中，该有多好。阿婆年纪已大，稀疏花白的头发挽成一个紧致、干瘪的发髻，紧贴在脑后，额头的皱纹一道一道深如沟壑，仿若刚刚才从岁月深处走出。当她朝阿盖笑的时候，却有一种慈祥的安宁，又有一种沧桑的疼痛。
回到中庆的那一天，阿盖喝下了孔雀胆，这副孔雀胆，正是梁王交给她要她毒死段功的那副，她用在了凌云身上，也留给了自己。恍惚间，她终于回到了家乡——和煦的微风荡过一望无垠的草原，肥美的水草如波浪般起伏，蓝天白云之下，成群的牛羊若隐若现。那条玉带般的小河一如，夏肥冬瘦，于日月之间，无休无止地朝东奔流……
段功死后，其子段宝即位为第十代大理总管。段僧奴则主动下嫁建昌头人阿荣，意图阿荣发兵共讨梁王。临行前，段僧奴将一面“替父雪恨”丝线绣旗刺指血染红，交给段宝，相约三年后一齐发兵夹击梁王，为父报仇。
梁王孛罗知道大理决不会就此善罢甘休，决意趁段宝刚刚即位之时，抢先下手，派大军进攻大理，兵败后这才知道段宝虽然年幼，却是不好欺负，只得请人从中周旋，又奏升段宝为云南左丞，双方暂时罢兵，云南百姓得以暂安。虽然表面相安无事，但梁段两家之间裂痕大大加深，不久，明昇发兵进攻中庆，孛罗遣使向大理借兵，段宝回信拒绝不说，还大肆挖苦孛罗。孛罗恨段宝入骨，派人往大理行刺段宝，结果未能成功。
因为段功终死于大理秘药孔雀胆，段宝下令药师殿销毁全部孔雀胆及药方。从此，世间再无孔雀胆，只有段功与阿盖的故事流传了下来，留给世人千古不绝的叹惋。
段功死后次年四月，梁王孛罗照常在罗汉山避暑行宫举办寿宴，有人特意献诗道：
贤君添算宴嘉宾，幄殿先施巨海滨。
万里晴天开锦绣，一川芳草踏麒麟。
笙歌暖送金杯酒，铠仗宽围玉佩人。
醉饱百官咸稽首，愿王高寿过千春。
孛罗听到“愿王高寿过千春”一句，不禁捋须微笑，正志得意满时，忽然两眼一翻，口吐白沫，歪倒在宝座上死去。其子阿密继为新一任梁王，即历史上最后一任梁王把匝刺瓦尔密。阿密疑心是大理下毒害死孛罗，一心攻伐大理。
又过了一年，公元1368年，朱元璋建立明朝，明军攻陷大都，元朝皇帝妥懽帖睦尔逃奔漠北，元朝灭亡。在此江山易主的局面下，大理和梁王阿密不得不共抗外敌，在新任鹤庆知事杨宝的劝说下，罢兵修好。
三年后，朱元璋遣汤和、廖永忠、傅友德等领兵征伐四川，明昇出城投降，明玉珍一手创建的夏国灭亡。明昇随即被变相流配到高丽，至今韩国有许多明姓人均为明昇后人。
十三年后，朱元璋任命傅友德为征南将军，蓝玉为左副将军，沐英为右副将军，统率三十万将士往征云南。梁王阿密派人向大理乞援，此时第十代大理总管段宝与母亲高兰死去不过几个月，传说二人是被梁王阿密派人下毒害死，不然为何母子死在同一日，而那天又刚巧是梁王孛罗的生日兼死忌？新即位不久的第十一代总管段世名衔于仇恨，拒绝发兵。中庆许多官员早不满梁王，见明军势如破竹，暗中策划举城投降，梁王阿密势蹙，终与王相驴儿带领全家跳滇池自尽。中庆不战而降，众父老焚香出迎明军。云南平章马哈只一家大小被明军俘虏，马哈只惊悸而死，马文铭等人则充军为奴，其幼弟马三宝时年十岁，因为年纪小，被阉割成太监，送往南京宫中为奴，后来机缘巧合下随侍燕王朱棣，因战功赐名郑和，即为鼎鼎大名的三宝太监。郑和因七下西洋显名发达后，将兄长马文铭长子过继为自己的嫡子，取名为郑文铭。
平定梁王后，明军兵锋直指大理，显示了一个新建立的强大的中原王朝的决心。具有讽刺意义的是，明军采取了“神机铳居前，马队居后，步卒居中”新式战阵，大展神威的神机铳正是焦玉所发明的火铳。明军的武力惊碎了阳苴咩城的繁华，烽烟四起，人喊马嘶，城墙在混战中土崩瓦解，重楼火光映天，大理总管段世名也做了俘虏。段氏世土，至此而绝。
然而大理的劫难还不止于此。已经改投明军大将蓝玉麾下的许江武告知藏宝图一事，蓝玉志在金银珠宝，遍寻藏宝图不着，纵火烧了翠华楼和五华楼，大小熊熊，三天三夜后方才熄灭。大理号称“文献名邦”，二座楼中藏有大量蒙段历代经史，灿烂的文明，悲情地毁灭，从此大理史籍多中断湮灭。
为彻底铲除段氏在云南的势力，避免再出现元代大理与梁王分庭抗礼的局面，朱元璋命人将段氏所有重要人物及世家大族头面人物械送京师南京，数目达数百人之多，其中也包括一直滞留在无为寺读书的罗贯中。他们中的极少数人被授予官职，软禁在官邸，绝大部分则被是在狱中被残酷折磨至死，如最后一任总管段世名被朱元璋以“名”犯“明”讳诛杀等。罗贯中因先为张士诚幕僚，后又为大理效力，格外引起朱元璋注意。最终在刘伯温的周旋下，朱元璋准许罗贯中出狱写《三国演义》一书。
中原巨富沈富因富可敌国为朱元璋所忌，被籍没家产后流配到北方苦寒之地为奴。两年后，沐英突然奏称云南多金矿，需要一个能发现矿产和善于理财的人，沈富正是一个合适的人选，请求将沈富改为流配云南大理。沈万三擅长做生意不假，不过与看风水地形似乎是两码事，因而这个寻矿一说就饶有深意了，朱元璋竟也准奏，传闻其实是沈富知道大理宝藏下落。后来大将军蓝玉被杀，传说也与藏宝图有关。不过世人费尽心机，始终没有找到传说中的宝库，南诏宝藏遂与双耳金瓶一道成为历史千古之谜，至今尚有人在不断发掘寻找。
明军毁坏大理都城后，又在城东新建了一座新城，是为今日之大理城。古老的阳苴咩和与它有关的一切美丽传说都化作烟尘，最终消失在冰冷的空气中。然而，大理最终还是浴血而生。这片大地上的人们有着坚韧、宽容、善良的禀性，他们受到了血与火的洗礼，依旧在蹒跚地成长。
云南全境平定后，朱元璋设立云南都指挥使司和云南布政使司，管理云南军政事务，留义子沐英镇守云南，从此沐氏子孙世守其地，直到明朝灭亡。沐英听说段功和阿盖的故事后，很受感动，在觉照寺附近修建阿姑庙来纪念二人，后人有词叹道：
芳草晴沙，阿姑归庙。
杨柳参差，风景不殊。
山河已异，飞燕谁家？
香魂杳杳天涯。
诉幽恨，空闻暮鸦。
凭吊凄然，半轮冷月，一树茶花。
明军平定云南的次年，昔日的大理宝姬段僧奴回到家乡，感慨万分。在昔日父亲下属杨安道、张继白等人的协助下，于无为寺东侧建了一座庚子兰苑，里面种有名贵兰花百余种，从此持素布衣，自号“兰室居士”，隐居于山林中。杨安道将庚子兰苑中的名贵兰花写成一本书，段僧奴亲自题名《南中幽芳录》。
那一日，段僧奴来到崇圣寺祭拜父母，回首如烟往事，心中激荡不已。昔日伙伴杨宝、高浪均死于战火，伽罗因嫁了段文也被明军捉到南京幽禁至死，如今只剩了她自己，孤零零的一个人形影相吊。她没有了国，没有了家，没有了父，没有了夫，与生俱来的自信和引以为傲的豪气早就被摧毁殆尽，以致时常怀疑起自己活在世上的意义来。
人有灵魂吗？它会离开人的躯体，在神秘的天国漫游吗？如果真有的话，她真的很想去天上找他们，父亲，母亲，杨宝，伽罗，那一个个熟悉而不能忘怀的名字，她想跟他们在一起。
一时间，热泪纵横，恣意汪洋，再也不能抑止。
忽听见背后有人走近，段僧奴惊然回过头去，立即看见了一个再熟悉、再痛恨不过的人，虽然形容枯槁憔悴，苍老了许多，却分明是那个早已经死在孔雀胆剧毒下的凌云，愣得一愣，才问道：“怎么会是你？”凌云道：“宝姬说过，要亲手杀了我报仇，现在我来受死了。”